为快速应对突发公共卫生事件，高效开展实验室检测，提高未知病原菌的检测能力和工作效率，市疾控中心新购置一台飞行质谱仪，目前已完成了仪器安装、调校及人员培训等相关工作。
飞行质谱仪能对3000多种致病细菌、酵母样真菌、丝状真菌、皮肤真菌、分枝杆菌等进行鉴定。其高通量全程自动判读、自动分析、自动报告。飞行质谱仪操作流程只需简单四步骤：涂菌、加基质、上机、读结果，整个检测过程无需革兰氏染色，且待测菌只需要单个菌落即可上机鉴定。飞行质谱2分钟内完成检测，相比传统的微生物全自动生化鉴定需要24小时的菌落纯培养和4-8小时上机，极大缩短了检测时间；飞行质谱检测通量为一次可检测96个目标菌，8小时可以完成800个或以上目标菌检测，而传统全自动生化鉴定仪的通量一次仅为8-32个目标菌，完成800个目标菌检测则需要30天左右；飞行质谱的检测成本低仅为2-10元/1个菌，传统全自动生化检测成本为80-100元/1个菌。飞行质谱仪检测未知微生物的快速高效、高通量、低成本，有力增强了我中心卫生应急突发事件处理能力、食品安全风险监测和水质检测微生物鉴定能力；进一步加强了我中心对全市食品和饮水安全、疾病预防的防控能力。