阐明宿主体内的病毒动力学对于制定针对新冠病毒的公共卫生措施而言非常重要，特别是在传播潜力迅速增强的感染早期阶段。2023年8月的《The Lancet. Microbe》刊载了一项研究，旨在分析奥密克戎变种的病毒和抗体动力学与症状发作或实验室确诊以及整个感染过程中的复制动力学的关系。

　　该项前瞻性队列研究对2020年1月11日至2022年4月24日期间入住深圳市第三人民医院的经实验室确诊的新冠病毒感染者进行了资格筛查。该研究纳入了未使用针对新冠病毒的抗病毒药物的急性新冠病毒感染的免疫功能正常患者。对一系列鼻咽拭子和血浆样本进行了新冠病毒的病毒RNA和特异性IgG抗体分析。通过局部估算的散点图平滑曲线拟合多项式回归计算与症状发作或实验室确诊和整个感染过程中复制动力学相关的比较病毒和抗体动力学。使用Mann-Whitney U检验和Gehan-Breslow-Wilcoxon方法分析了病毒和抗体动力学与疫苗接种、年龄、性别、疾病严重程度和基础健康状况之间的关系。

　　从2043例急性新冠病毒感染患者中采集了15406份连续鼻咽拭子和2324份血浆样本(n=217原型[A.1]和D614G [B.1]变种[野生型];n=105 德尔塔变种[B.1.617.2];n=1721 奥密克戎变种[B.1.529])，并纳入分析。症状出现后第一天(dpo;定义为无症状受试者经实验室确诊后第一天)，奥密克戎变种的平均Ct值为22.65(95% CI 22.05-23.26)。在平均3.19 dpo时达到病毒载量峰值，平均Ct值为17.63(17.47-17.79)(95% CI 3.09-3.28)，在平均13.50 dpo时实现病毒清除(Ct值>35)(95% CI 13.32-13.67)。奥密克戎变种显示出比野生型新冠病毒和德尔塔变种更快的病毒复制和清除，并且在第一次dpo时的病毒载量和峰值病毒载量低于德尔塔变种但高于野生型新冠病毒。年龄、性别、疾病严重程度和基础健康状况与奥密克戎变种的病毒动力学有关，在年轻(0-14岁)、男性和无症状受试者以及无基础健康疾病的受试者中发现病毒清除速度更快。整个感染过程的复制动力学显示，奥密克戎变种的病毒载量峰值平均为5.06 dpo(4.76-5.36)，病毒清除平均需要14.27天(13.6-14.93)。尽管在最后一次接种疫苗和感染之间的间隔时间较长(> 7个月)，但在突破性感染中，新冠病毒特异性IgG比初次感染奥密克戎变种更早、更快地增加至明显更高的浓度。

　　研究者们的数据提供了急性新冠病毒感染人群中奥密克戎变种的纵向病毒和抗体动态的综合概述，对包括人群筛查、抗病毒治疗、隔离期和疫苗接种的公共卫生策略制定具有重要意义。

　　资金支持：国家自然科学基金和广州实验室应急重点项目。

　　原文出处：Yang Y, Guo L, Yuan J, Xu Z, Gu Y, Zhang J, Guan Y, Liang J, Lu H, Liu Y. Viral and antibody dynamics of acute infection with SARS-CoV-2 omicron variant (B.1.1.529): a prospective cohort study from Shenzhen, China. Lancet Microbe. 2023 Aug;4(8):e632-e641. doi: 10.1016/S2666-5247(23)00139-8. Epub 2023 Jul 14. Erratum in: Lancet Microbe. 2023 Aug;4(8):e576. PMID: 37459867.

　　链接：https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/37459867/